インストール方法(Linux)

参考

http://www.pymolwiki.org/index.php/Linux_Install
できるだけ一般ユーザの権限で頑張る(CentOS7)
以下のパッケージは、さすがにrootで。
# yum install subversion gcc gcc-c++ kernel-devel python-devel tkinter glew-devel \

  freeglut-devel libpng-devel freetype-devel libxml2-devel
以降、demoユーザで。
pymolのソースを展開しディレクトリ移動

$ python setup.py build install --home=/home/demo/pymol/1.7.4.0 --install-lib=/home/demo/pymol/1.7.4.0/modules --install-scripts=/home/demo/pymol/1.7.4.0
pymolwikiにはpython-pmwパッケージとあるがcentos7ではないようなので。
Pmwソースを入手・展開、移動後(Pmw-2.0.0使用、どのVerでもよいはず)

$ python setup.py build install --install-lib=/home/demo/pymol/1.7.4.0/modules
以上で終わり。
直接は関係ないけども、libGLでドライバロードに失敗した場合、
# usermod -aG video myuser
で対処できるらしい。ユーザ制御の問題かな。

https://bbs.archlinux.org/viewtopic.php?id=170943